无人机运营合格证的申请时间因地区和流程而异，具体如下：

华北地区（北京、天津、山西、内蒙古、河北）：30个工作日内。

东北地区（黑龙江、吉林、辽宁）：30个工作日内。

中南地区（湖南、湖北、河南、广西、广东、海南）：45~60个工作日内。

华东地区（上海、浙江、江苏、山东、江西、福建、安徽）：25个工作日内。

西南地区（四川、重庆、云南、贵州、西藏）：30个工作日内。

西北地区（陕西、宁夏、甘肃、青海）：30个工作日内。

新疆地区（新疆）：30个工作日内。