无人机运营合格证的办理流程：

1. 准备材料：填写完整的申请表格，包括企业基本信息、无人机类型、用途、使用范围等。同时，还需要提供相关的证明材料，如企业营业执照、无人机技术资料、运营人员资质证明等。

2. 提交申请：将申请材料提交至所在地民航地区管理局。

3. 初审：民航地区管理局对申请材料进行初审，如有需要，可能会进行现场核查。

4. 上报审批：通过初审后，民航地区管理局将申请材料上报至中国民用航空局。

5. 审查决定：中国民用航空局对申请材料进行审查，并作出是否颁发无人机运营合格证的决定。

6. 领取证书：如果申请获得批准，可以领取无人机运营合格证。

需要注意的是，具体的办理流程可能因地区和政策的不同而有所差异。在办理之前，建议详细了解当地的相关规定和要求，并确保申请材料的完整性和准确性。此外，还需要遵守相关的法律法规和飞行安全规定，确保无人机的运营合法合规。